ที่มาแน่ชัดของชื่อโกฏิกโกฏไม่เป็นที่ทราบชัดเจน ข้อมูจากหลายแหล่งเชื่อว่าชื่อนี้มาจากคำว่า โกยิล-โกฏ ซึ่งแปลว่า วังอันมีป้อมล้อมรอบ[10] โกยิล เป็นคำในภาษามลยาฬัมและภาษาทมิฬ ในปัจจุบันนิยมใช้เรียกโบสถ์พราหมณ์ ส่วนในชื่อนี้อาจหมายถึงฏาฬีศิวโกยิล[11] ต่อมาชื่อนี้จึงกร่อนเหลือ โกฬิโกฏ หรือชาวอาหรับเรียกว่า กาลิกูต (Qāliqūṭ)[12] ที่ซึ่งกลายมาเป็นรูปภาษาอังกฤษว่า คาลีคัต (Calicut)[13] ในเอกสารของจีนโบราณเรียกเมืองนี้ว่า จูฟันจี้ (จีน: 诸番志; zhū fān zhì) ส่วนชาวทมิฬเรียกว่า กัฬฬิโกฏไฏ (Kallikottai) [14]

คำว่า คาลิโก ซึ่งเป็นคำเรียกชนิดหนึ่งของผ้าฝ้ายทอมือชั้นดีที่ในอดีตส่งออกมาจากโกฬิกโกฏ ที่ซึ่งต่อมาถูกนำมาใช้เรียกแมวสามสีหรือแมวคาลิโก เข้าใจว่าน่าจะมาจากคำว่า Calicut[15][16][17]