ตัวละครที่สามารถเล่นในเนื้อเรื่องหลักได้

• เอเมิร์ล - เอเมิร์ลเป็นตัวละครหลักของเกม ผู้เล่นจะต้องต่อสู้ร่วมกับเขาตลอด 7 ตอนของแต่ละคน ตัวตนของเอเมิร์ลที่แท้จริงคือ "กิซอยด์" สุดยอดสิ่งมีชีวิตที่ถูกสร้างโดยศจ.เจอรัลด์ โรบ็อทนิก เอเมิร์ลมีความสามารถในการลอกเลียนแบบท่วงท่าของพวกเดียวกันหรือฝ่ายตรงข้ามมาในรูปแบบของการ์ด ซึ่งทำให้เขาใช้ท่าต่างๆที่พวกโซนิคใช้ได้ ในตอนท้ายของเกมเขาจะปลดปล่อยพลังที่แท้จริงทำให้มีพลังที่สูงขึ้นกว่าปกติ
• โซนิค เดอะเฮดจ์ฮ็อก
• ไมลส์ "เทลส์" พราวเวอร์
• นัคเคิลส์ ดิ เอคินด้า
• เอมี่ โรส
• ครีม เดอะแรบบิท
• ชาโดว์ เดอะเฮดจ์ฮ็อก
• รู้จ เดอะแบท

ตัวละครที่ปรากฏมาในฐานะคู่ต่อสู้

• อี-102 คาออสแกมม่า - เขามีการ์ดให้เก็บและสามารถเล่นเป็นเขาผ่านทางโหมดต่อสู้เท่านั้น
• อี-104 ฟิ - เอเมิร์ลรุ่นต้นแบบ สามารถเล่นเป็นเขาได้ผ่านทางโหมดต่อสู้เท่านั้น
• คาออส - เขามีการ์ดให้เก็บและสามารถเล่นเป็นเขาผ่านทางโหมดต่อสู้เท่านั้น
• ดร.เอ็กแมน - ไม่สามารถเล่นเป็นเขาได้ด้วยวิธีปกติ ต้องผ่านสูตรโกงแต่จะควบคุมไม่ได้