โรงเรียนน้ำพองศึกษา จัดการเรียนการสอนแบบสหศึกษา ตั้งแต่ระดับชั้นมัธยมศึกปีที่ 1 - 6 โดยแบ่งแผนการเรียนดังนี้

• ระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น แบ่งออกเป็น 12 ห้องเรียน

1. ห้อง 1 ห้องโครงการส่งเสริมศักยภาพด้านคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์ (GIFTED)
2. ห้อง 2 แผนการเรียนปกติ (KING)
3. ห้อง 3 - 12 แผนการเรียนปกติ

• ระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย แบ่งออกเป็น 10 ห้องเรียน

1. ห้อง 1 แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - ภาษาญี่ปุ่น
2. ห้อง 2 แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - คณิตศาสตร์
3. ห้อง 3 แผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ และเทคโนโลยี
4. ห้อง 4 - 8 แผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์
5. ห้อง 9 แผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ (KING)
6. ห้อง 10 แผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ ห้องโครงการส่งเสริมศักยภาพด้านคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์ (GIFTED)