โรงเรียนภูเก็ตวิทยาลัย มีแผนการจัดชั้นเรียน มีดังนี้

ระดับมัธยมศึกษาตอนต้น

• โครงการส่งเสริมความสามารถด้านคณิตศาสตร์ วิทยาศาสตร์ เทคโนโลยี และภาษาต่างประเทศ
• การจัดการศึกษาทั่วไปตามหลักสูตรการศึกษาขั้นพื้นฐาน
• ห้อง English Program (EP)
• การจัดการศึกษาวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ (วิทย์-คณิต)(เฉพาะ ม.2-ม.3)

ระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย

แผนการเรียนวิทยาศาสตร์

• โครงการเสริมสร้างศักยภาพด้านวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ เทคโนโลยี และสิ่งแวดล้อม (ภาคสมทบ)(เป็นโครงการจัดห้องเรียนพิเศษจำนวน 207 แห่งทั่วประเทศที่กำกับติดตามโดย สสวท.)
• การจัดการศึกษาวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ (วิทย์-คณิต ทั่วไป)

แผนการเรียนศิลปศาสตร์

• โครงการเสริมสร้างศักยภาพด้านภาษาอังกฤษ คณิตศาสตร์ (ศิลป์คำนวณพิเศษ)
• การจัดการศึกษาภาษาอังกฤษ คณิตศาสตร์ (ศิลป์คำนวณ)

การจัดการศึกษาทางด้านศิลปศาสตร์ (ศิลป์ภาษา)

• การจัดการศึกษาภาษาอังกฤษ-ภาษาฝรั่งเศส
• การจัดการศึกษาภาษาอังกฤษ-ภาษาจีน
• การจัดการศึกษาภาษาอังกฤษ-ภาษาญี่ปุ่น

กิจกรรม

1. ประเพณีการรับน้องใหม่ เรียกวันรับน้องใหม่ว่า วันเพาะกล้าชงโค
2. การแข่งขันกีฬาภายในโรงเรียนงานกีฬาสี
3. งานแสดงมุทิตาจิต ต่อคุณครูที่เกษียณอายุราชการและคุณครูที่ลาออกก่อนเกษียณอายุราชการ
4. การแข่งขันกีฬา กรีฑา นักเรียน นักศึกษาและประชาชนจังหวัดภูเก็ต ซึ่งโรงเรียนภูเก็ตวิทยาลัยดำเนิน การแปรอักษร มากว่า 30 ปี
5. การแข่งขัน กีฬาประเพณีไตรภาคี เป็นการแข่งขันกีฬาร่วมกันระหว่าง3โรงเรียนในจังหวัดภูเก็ต คือ โรงเรียนภูเก็ตวิทยาลัย โรงเรียนสตรีภูเก็ต และ โรงเรียนเฉลิมพระเกียรติสมเด็จพระศรีนครินทร์ภูเก็ต
6. การแข่งขันกีฬาประเพณีฟุตซอลีกในระดับชั้น ม.5
7. วันเปิดประตูสู่สถานศึกษาภูเก็ตวิทยาลัย Open House
8. การแข่งขันกีฬาฟุตบอลประเพณีอำลาคัพ ซึ่งแข่งขันกันในระดับชั้น ม.3 และ ม.6
9. ประเพณี วันพี่อำลาน้อง จัดขึ้นในระดับ ม.6 เพื่อให้รุ่นพี่ชั้น ม.6อำลารุ่นน้อง ซึ่งเป็นวันเปิดเรียนวันสุดท้ายของชั้น ม.6
10. งานปัจฉิมนิเทศ จัดขึ้นเพื่อแสดงความสำเร็จแก่นักเรียนชั้น ม.3 และ ม.6 เรียกว่า วันชงโคปัจฉิมนิเทศ