ในปัจจุบัน โรงเรียนมารีวิทยา ตั้งอยู่บนพื้นที่ 4 ไร่ ประกอบด้วยอาคารเรียนคอนกรีตเสริมเหล็กสูง 6 ชั้น จำนวน 2 อาคาร ได้แก่ อาคาร 25 ปี และอาคารเซนต์โยเซฟ ซึ่งภายในอาคารทั้งสองจะประกอบด้วยห้องเรียน ห้องปฏิบัติการต่างๆ แล้ว ยังมีห้องประชุม ห้องสมุด โรงอาหาร ลานเอนกประสงค์ขนาดใหญ่ ธนาคารขยะรีไซเคิล ธนาคารโรงเรียน และห้องพิพิธภัณฑ์เฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว เนื่องในวโรกาสฉลองสิริราชสมบัติครบ 60 ปี นอกจากนี้ยังมีอาคารคอนกรีตเสริมเหล็กสูง 3 ชั้น อีก 1 หลัง คือ อาคารเซนต์เมรี่ สำหรับเป็นอาคารอำนวยการ และใช้เป็นห้องเรียน ห้องสมุดและห้องปฏิบัติการสำหรับนักเรียนระดับชั้นอนุบาล และนักเรียนในหลักสูตร MEP เปิดทำการเรียนการสอนในระดับปฐมวัย ถึงระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย มีการจัดการสอนภาษาอังกฤษโดยครูชาวไทย ชาวอังกฤษ และชาวฟิลิปปินส์ที่เชี่ยวชาญ และมีการจัดการสอนภาษาจีนกลางโดยครูชาวจีน ตั้งแต่ระดับชั้นอนุบาล ถึงชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย (ยกเว้นชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย สายวิทยาศาสตร์-คณิตศาสตร์) และมีนักเรียนที่สำเร็จการศึกษาระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลายแล้ว 3 รุ่น และสามารถเข้าศึกษาต่อในสถาบันอุดมศึกษาได้ทุกคน

ในปี พ.ศ. 2553 ซึ่งเป็นวาระครบรอบ 50 ปีแห่งการก่อตั้งโรงเรียน คณะผู้บริหาร คณะครู นักเรียน และศิษย์เก่าจึงได้ร่วมจัดงานฉลอง 50 ปี การก่อตั้งโรงเรียนมารีวิทยา ในวันที่ 5 มีนาคม พ.ศ. 2553 โดยในช่วงเช้า มีพิธีมอบประกาศนียบัตรแก่นักเรียนที่สร้างชื่อเสียงให้กับโรงเรียน และนักเรียนที่สำเร็จการศึกษาในระดับชั้นอนุบาล 3 ชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 และชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 6 และช่วงเย็นมีงานฉลองสังสรรค์ภายใต้ชื่องานว่า "50 ปี เพื่อการศึกษา ก้าวไปข้างหน้าเพื่อสังคม" โดยนายศิริพงษ์ ห่านตระกูล ผู้ว่าราชการจังหวัดปราจีนบุรีเป็นประธานเปิดงาน ในงานมีการฉายภาพยนตร์ฉลอง 50 ปีมารีวิทยา การแสดงจากนักเรียน และพิธีกตัญญุตาต่อบูรพาจารย์ของศิษย์เก่า และในปีนี้ คณะรักกางเขน แห่งจันทบุรี ได้มีการปรับย้ายผู้บริหารคณะใหม่ โดยให้ ซิสเตอร์ ดร.ลำยงค์ อุ้นวุ้น ผู้อำนวยการโรงเรียนมารีวิทยา จ.ปราจีนบุรี ไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสตรีมารดาพิทักษ์ จ.จันทบุรี และให้ ซิสเตอร์ อัจฉรา สุขพิบูลย์ รองผู้อำนวยการฝ่ายบริหารทั่วไป และฝ่ายวิชาการมัธยมศึกษาตอนต้น โรงเรียนสตรีมารดาพิทักษ์ เข้ารับตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนมารีวิทยา ตั้งแต่วันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ. 2553 เป็นต้นไป