พ.ศ. 2510 (ค.ศ. 1967) นั้นมีการขยายตัวของประชาชนในบริเวณแขวงบางมด เขตทุ่งครุ ซึ่งเป็นเยาวชนจำนวนมาก จึงมีการตระหนักถึงการศึกษามากขึ้น แต่ในสมัยนั้นไม่มีโรงเรียนในละแวกนั้น ซึ่งการที่จะส่งบุตรหลานไปศึกษาเล่าเรียนนั้น ก็ต้องเสียค่าใช้จ่ายในการเดินทางเป็นจำนวนมาก ทำให้พระครูวินัยสารสุภัทรซึ่งเป็นเจ้าอาวาสของวัดพุทธบูชาในเวลานั้น ได้จัดซื้อที่ดินกว่า 8 ไร่ เพื่อมอบให้สำหรับเป็นการจัดสร้างโรงเรียน และท่านยังได้ประสานงานกับทางราชการเพื่อก่อตั้งโรงเรียน

19 เมษายน พ.ศ. 2516 (ค.ศ. 1973) กระทรวงศึกษาธิการได้มีการจัดตั้งโรงเรียนขึ้นอย่างเป็นทางการ มีชื่อว่าโรงเรียนพุทธบูชาวิทยาคม ซึ่งเป็นโรงเรียนประเภทสหศึกษา

4 มิถุนายน พ.ศ. 2516 (ค.ศ. 1973) โดยได้เปิดเรียนครั้งแรก โดยมีนายอินทร์ วงศ์สมบูรณ์ เป็นครูใหญ่ และในระยะเริ่มแรกนี้โรงเรียนต้องอาศัยโรงเรียนประถมสายสามัญวัดพุทธบูชาและศาลาวัดเป็นที่เรียน ต่อมาท่านเจ้าอาวาทได้จัดตั้งอาคารเรียนชั่วคราวจำนวน 6 ห้องเรียน เพื่อรองรับกับจำนวนนักเรียนที่มากขึ้น

พ.ศ. 2518 โรงเรียนได้รับเงินงบประมาณจากกรมสามัญศึกษาให้สร้างอาคารเรียนเป็นตึก 3 ชั้น 18 ห้องเรียน

พ.ศ. 2520 ย้ายเข้าไปเรียนในอาคารเรียนหลังใหม่ และในปีเดียวกันนี้ได้ยุบรวมกับโรงเรียนประถมสายสามัญวัดพุทธบูชากับโรงเรียนพุทธบูชาวิทยาคมเข้าด้วยกันและได้เปิดสอนระดับมัธยมศึกษาเพียงอย่างเดียว

พ.ศ. 2527 (ค.ศ. 1984) โรงเรียนพุทธบูชาวิทยาคม ได้เปลี่ยนชื่อเป็น โรงเรียนวัดพุทธบูชา
และมีจำนวนนักเรียน ครูอาจารย์ตลอดจนอาคารเรียน ประกอบเพิ่มมากขึ้นตามลำดับ นักเรียนที่เข้ามาศึกษามีทั้งเป็นนักเรียนท้องถิ่นชุมชนบางมด แล้วยังมาจากที่อื่นอีก เช่น เขตราษฎร์บูรณะ เขตจอมทอง เขตบางขุนเทียน เขตคลองสาน เขตยานนาวา เขตบางคอแหลม เขตธนบุรีและจากอำเภอพระประแดง จังหวัดสมุทรปราการ เป็นต้นจำนวนห้องนักเรียนปีการศึกษา2556'ม.1,2,3 รวม 21 ห้องเรียนม.4,5,6 รวม 23 ห้องเรียนรวมทั้งหมด 44 ห้องเรียนในปัจจุบันโรงเรียนวัดพุทธบูชามีนักเรียนประมาณ 1,800 คน จัดเป็นโรงเรียนระดับมัธยมศึกษาขนาดใหญ่