โรงเรียนสถาพรวิทยา เดิมเป็นโรงเรียนราษฎร์ชื่อว่า โรงเรียนวัดเวฬุวนาราม จัดตั้งขึ้นโดยพระครูสถาพรพุทธมนต์ (หลวงพ่อสำเนียง อยู่สถาพร) เจ้าอาวาสวัดเวฬุวนาราม โดยมีวัตถุประสงค์ต้องการให้นักเรียนยากจน เด็กเร่ร่อน เด็กที่ขาดโอกาสทางการศึกษาให้มีโอกาสได้รับการศึกษา และเปิดรับนักเรียนเข้าเรียนระดับประถมศึกษาปีที่ 1–4 ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2492

ในปี พ.ศ. 2515 โรงเรียนได้ขยายการรับนักเรียนเข้าเรียนถึงชั้นประถมศึกษาปีที่ 5–7 และกรมสามัญศึกษา กระทรวงศึกษาธิการในขณะนั้น ได้รับโอนมาเป็นโรงเรียนรัฐบาลในสังกัด เมื่อวันที่ 27 มิถุนายน พ.ศ. 2515 จึงได้เปลี่ยนชื่อโรงเรียนเป็น โรงเรียนสถาพรวิทยา และเปิดทำการสอนแบบสหศึกษา ตั้งแต่ระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 ถึงมัธยมศึกษาปีที่ 3

ต่อมาในปีการศึกษา 2524 กรมสามัญศึกษาอนุญาตให้เปิดทำการเรียนการสอนถึงระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย แผนชั้นเรียน 2:2:2 และ 1:1:1 รวม 9 ห้องเรียน กรมสามัญได้จัดสรรงบประมาณการก่อสร้างอาคารเรียนเพิ่มเติม โดยฉาบผนัง ทำบันได ทาสี เดินสายไฟฟ้า ติดตั้งอุปกรณ์แสงสว่างภายในอาคารเรียนทั้งหมด จนเสร็จสมบูรณ์

           ปีงบประมาณ 2528 ได้รับงบประมาณในการก่อสร้างอาคารประกอบ อาคาร โรงฝึกงานตามแบบกรมสามัญ จำนวน 1 หลัง(2 หน่วย) เป็นเงินงบประมาณ 780,000 บาท (เจ็ดแสนแปดหมื่นบาทถ้วน)