มัธยมศึกษาตอนต้น

การรับนักเรียนเข้าศึกษาต่อในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 จะรับสมัครนักเรียนชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 เข้ารับการสอบข้อเขียน โดยมี 3 ประเภท 7 ห้องเรียนดังนี้

• ประเภทโครงการห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ − คณิตศาสตร์และโครงการส่งเสริมศักยภาพนักเรียนสู่ความเป็นเลิศ (ทุนการศึกษาแพทย์คนแรก) จำนวน 1 ห้องเรียน
• ประเภทหลักสูตรห้องเรียนคุณภาพ (Quality Classroom) จำนวน 1 ห้องเรียน
• ประเภทห้องเรียนปกติ จำนวน 5 ห้องเรียน

กิจกรรมพัฒนาผู้เรียนโครงการห้องเรียนวิทยาศาสตร์ (Special Program)กิจกรรมพัฒนาผู้เรียนที่กำหนดให้นักเรียนในโครงการห้องเรียนวิทยาศาสตร์เข้าร่วมแบ่งเป็น 2 กิจกรรมย่อย คือ

• กิจกรรมที่ต้องจัดร่วมกับนักเรียนในโรงเรียน
• กิจกรรมพิเศษเพื่อเพิ่มพูนประสบการณ์นอกห้องเรียนให้นักเรียนได้รับความรู้จากประสบการณ์ตรง

มัธยมศึกษาตอนปลาย

การรับนักเรียนเข้าศึกษาต่อในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 4 จะให้โควตากับนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 เดิมของโรงเรียนสวนกุหลาบวิทยาลัย นครศรีธรรมราชที่ผ่านเกณฑ์ตามที่โรงเรียนกำหนดก่อน จำนวน 130 คน และนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 ทั่วไป จำนวน 30 คน เข้ารับการสอบข้อเขียนและสัมภาษณ์ โดยมี 4 หลักสูตรดังนี้

• หลักสูตรห้องเรียนคุณภาพแผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ (Science-math Quality Classroom) จำนวน 1 ห้อง
• หลักสูตรแผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ปกติ จำนวน 1 ห้อง
• หลักสูตรแผนการเรียนศิลป์ - คำนวณ (ภาษาอังกฤษ - คณิตศาสตร์) จำนวน 1 ห้อง
• หลักสูตรแผนการเรียนศิลป์ - ภาษาไทย - สังคมศึกษา จำนวน 1 ห้อง