ไฟร์เอมเบลมเป็นเกมชุดแรกๆในแนวเกมวางแผนผลัดกันเดิน บนเครื่องคอนโซล อย่างไรก็ตาม ตัวเกมมีความแตกต่างจากเกมแนววางแผนเกมอื่น โดยการนำหลายๆระบบจากเกมแนวสวมบทบาท เช่น Dragon Quest และยังเป็นเกมแรกๆ ถ้าไม่ใช่เกมแรกในเกมแนววางแผนสวมบทบาทอีกด้วย ต่อมาเกมในชุดมีการเปลี่ยนแปลงในระบบการเล่น ด้านล่างนี้คือรายการการเปลี่ยนแปลงระบบการเล่น ที่เห็นได้ชัดเจนสำหรับเกมภาคนี้กับเกมภาคอื่น:

• ไม่มีสีสำหรับที่บ่งบอกขอบเขตระยะที่สามารถเคลื่อนที่ได้ และ ผู้เล่นต้องใช้ลูกศร เพื่อขยับหาระยะที่ตัวละครตัวนั้นเคลื่อนที่ไปได้
• ตัวละครถือไอเทมได้เพียงสี่ชิ้นเท่านั้น ซึ่งรวมอาวุธแล้ว นอกจากนี้ยังไม่สามารถแลกเปลี่ยนไอเทม หรือ อาวุธระหว่างตัวละคร ผู้เล่นสามารถให้อาวุธ หรือ ไอเทมกับตัวละครอื่นได้ ถ้าตัวละครนั้นถือไอเทม หรือ อาวุธไม่ถึงสี่ชิ้น แต่ตัวละครนั้นก็จะไม่สามารถขยับได้ในตานั้น
• โกดังอาวุธ และ ไอเทมนั้นมีลักษณะเป็นเต็นท์ (รูปแบบคล้ายคลึงกับในภาค Fire Emblem) และมีค่าบริการครั้งละสิบเหรียญในการเก็บอาวุธ/ไอเทม แต่ไม่เสียค่าบริการในการถอนไอเทมออกมา นอกจากนี้ผู้เล่นไม่สามารถซื้อไอเทม และ อาวุธ แล้วส่งไปยังที่โกดังโดยตรง ซึ่งหมายความว่า ตัวละครที่มีของเต็มจะไม่สามารถซื้อได้ อย่างไรก็ตาม ไอเทมที่ได้รับจากตัวละครศัตรูสามารถส่งไปยังโกดังได้ทันที
• เกมภาคนี้เป็นภาคเดียวในเกมชุดไฟร์เอมเบลมที่สามารถซื้อ rapier ได้ในร้านทั่วไป
• ตัวละครที่ทำหน้าที่รักษา (เช่น Cleric) จะไม่ได้ค่าประสบการณ์จากการใช้คทารักษา ทางเดียวที่ตัวละครจะได้ค่าประสบการณ์ คือ การรับการโจมตีจากตัวละครศัตรู (ถึงแม้ว่าจะหลบได้ก็ตาม)
• ตัวละครอาชีพ Pegasus Knight เปลี่ยนอาชีพเป็น Wyvern Rider เมื่อเลื่อนระดับอาชีพ ตั้งแต่หลังจากภาค Fire Emblem: Seisen no Keifu เป็นต้นมา Pegasus Knight และ Wyvern Rider เป็นอาชีพคนละอาชีพกัน อย่างไรก็ตามในภาค Sacred Stones อาชีพ Wyvern Rider เป็นตัวเลือกหนึ่งในการเปลี่ยนอาชีพของ Pegasus Knight
• ยังไม่มีระบบสามเส้าของอาวุธ หรือ ความสัมพันธ์ค้อน-กรรไกร-กระดาษ ของอาวุธแต่ละชนิด อย่างไรก็ตามอาวุธแต่ละชนิดยังคงคุณลักษณะของมัน เช่น ขวาน และ ทวนส่วนใหญ่นั้น สร้างความเสียหายได้สูง แต่แม่นยำน้อยกว่า ดาบ
• อาชีพโดยมาก เช่น Armored Knight, Axeman, Hunter, และ Thief ไม่สามารถเปลี่ยนอาชีพได้ อาชีพ Lord (Marth) ก็ไม่สามารถเปลี่ยนอาชีพได้เช่นกัน
• ปราสาทมีพื้นที่เพียงหนึ่งช่องเท่านั้น ซึ่งทำให้สามารถล้อมโจมตีหัวหน้าฉากทั่วๆไป จากทั้งสี่ทิศทางในหนึ่งตาเดินได้