กองกำลังและผู้สังเกตการณ์ข้ามชาติมีสำนักงานใหญ่หลักในกรุงโรม ซึ่งมีผู้อำนวยการใหญ่เป็นหัวหน้า นอกจากนี้ยังมีสำนักงานภูมิภาคสองแห่งในเทลอาวีฟและไคโร ในขณะที่กองกำลังมีฐานอยู่ในโซน C บนคาบสมุทรไซนาย ภายใต้การบังคับบัญชาของ ผู้บัญชาการกองกำลัง

ผู้บัญชาการกองกำลังมีหน้าที่รับผิดชอบส่วนประกอบทางทหารของกองกำลังและผู้สังเกตการณ์ข้ามชาติ ซึ่งประกอบด้วย:[9]

• กองบัญชาการ
• กองพันทหารราบ 3 กองพัน (FIJIBATT, COLBATT และ USBATT)
• กองพันสนับสนุนที่ 1 สหรัฐ (เดิมคือหน่วยสนับสนุนการส่งกำลังบำรุง)
• หน่วยลาดตระเวนชายฝั่ง (Coastal Patrol Unit: CPU)
• หน่วยบินปีกหมุน (Rotary Wing Aviation Unit: AVCO)
• หน่วยบินปีกตรึง (Fixed Wing Aviation Unit: FWAU)
• หน่วยขนส่งและวิศวกรรม (Transport and Engineering Unit: TREU)
• หน่วยสารวัตรทหาร (Military Police Unit: FMPU)
• หน่วยติดตามการบิน (ควบคุมการจราจรทางอากาศ)

กองกำลังสังเกตการณ์ของกองกำลังและผู้สังเกตการณ์ข้ามชาติ ประกอบด้วยพลเรือนสหรัฐทั้งหมด[10] ผู้สังเกตการณ์ได้รับมอบหมายจากกระทรวงการต่างประเทศสหรัฐ หรือบุคลากรทางทหารของสหรัฐที่เกษียณแล้ว