หน่วยบินที่วางกำลังในฐานบินวัฒนานคร ประกอบไปด้วย

กองทัพอากาศ

• กองบิน 3 (หน่วยหลัก)
  • ฝูงบิน 301
    • หน่วยบิน 3011[15] – RTAF U-1
  • ฐานปฏิบัติการฝนหลวง กองบิน 3[21]
    • หน่วยบินปฏิบัติภารกิจฝนหลวงกองทัพอากาศ[22]

กรมฝนหลวงและการบินเกษตร

• ศูนย์ปฏิบัติการฝนหลวงภาคตะวันออก
  • หน่วยปฏิบัติการฝนหลวงจังหวัดสระแก้ว[18] – เซสนา 208 คาราวาน[20]