ชิงกันเซ็ง

• ฮกไกโดชิงกันเซ็ง:
  • ชินอาโอโมริ - ชินฮาโกดาเตะโฮกูโตะ (148.9 km (92.52 mi))

สายระหว่างเมือง

• สายชิโตเซะ:
  • ชิโรอิชิ - นูมาโนฮาตะ (60.2 km (37.41 mi))
  • มินามิชิโตเซะ - ท่าอากาศยานชินชิโตเซะ (2.6 km (1.62 mi))
• สายหลักฮาโกดาเตะ
  • ฮาโกดาเตะ - โอนูมะโกเอ็ง - โอตารุ - อาซาฮิกาวะ (423.1 km (262.90 mi))
  • นานาเอะ - โอชิมะซาวาระ - โมริ (35.3 km (21.93 mi))
• สายหลักมูโรรัง
  • โอชามัมเบะ - ฮิงาชิมูโรรัง - โอนิวาเกะ - อิวามิซาวะ (211.0 km (131.11 mi))
  • ฮิงาชิมูโรรัง - มูโรรัง (7.0 km (4.35 mi))
• สายหลักเนมูโระ
  • ทาจิกาวะ - โอบิฮิโระ - เนมูโระ (443.8 km (275.76 mi))
• สายเซกิโช
  • มินามิชิโตเซะ - ชินโตกุ (132.4 km (82.27 mi))
  • ชิงยูบาริ - ยูบาริ (16.1 km (10.00 mi))

สายอื่น ๆ

• สายเอซาชิ
  • โนเรียวกากุ - คิโกไน - เอซาชิ (79.9 km (49.65 mi)) (ปัจจุบันช่วงคิโกไน-เอซาชิหยุดให้บริการแล้ว)
• สายฟูราโนะ
  • ฟูราโนะ - อาซาฮิกาวะ (54.8 km (34.05 mi))
• สายหลักฮิดากะ
  • โทมาโกไม - ซามานิ (146.5 km (91.03 mi))
• สายหลักเซกิโฮกุ
  • ชิงอาซาฮิกาวะ - คิตามิ - อาบาชิริ (234.0 km (145.40 mi))
• สายคานิเกียว
  • นากะโองูนิ - สึงารุอิมาเบ็ตสึ - คิโกไน (87.3 km (54.25 mi))
• สายหลักรูโมอิ
  • ฟูกางาวะ - มาชิเกะ (66.8 km (41.51 mi))
• สายซัชโช
  • โซเอ็ง - ชินตตสึกาวะ (76.5 km (47.53 mi))
• สายหลักเซ็มโม
  • ฮิงาชิกูชิโระ - อาบาชิริ (166.2 km (103.27 mi))
• สายหลักโซยะ
  • อาซาฮิกาวะ - นาโยโระ - วักกาไน (259.4 km (161.18 mi))