วานูอาตูมิได้เป็นเกาะเพียงเกาะเดียว ความจริงแล้วเป็นหมู่เกาะ มีเกาะน้อยใหญ่ทั้งหมด 83 เกาะ ในจำนวนนี้ มีอยู่ 2 เกาะ ได้แก่ เกาะแมตทิว (Matthew) และเกาะฮันเตอร์ ซึ่งถือเป็นดินแดนของนิวแคลิโดเนีย (ฝรั่งเศส)

ในบรรดาเกาะทั้ง 83 เกาะนั้น มี 14 เกาะที่มีเนื้อที่มากกว่า 100 ตารางกิโลเมตร ได้แก่

1. เกาะเอสปีรีตูซันตู (Espiritu Santo) : 3,956 ตารางกิโลเมตร
2. เกาะมาลากูลา (Malakula) : 2041 ตารางกิโลเมตร
3. เกาะเอฟาเต (Éfaté) : 900 ตารางกิโลเมตร
4. เกาะเอร์โรมันโก (Erromango) : 888 ตารางกิโลเมตร
5. เกาะแอมบริม (Ambrym) : 678 ตารางกิโลเมตร
6. เกาะแทนนา (Tanna) : 555 ตารางกิโลเมตร
7. เกาะปองต์โกต (Pentecôte) : 491 ตารางกิโลเมตร
8. เกาะเอปี (Épi) : 445 ตารางกิโลเมตร
9. เกาะแอมเบ (Ambae) หรือ เอาบา (Aoba) : 402 ตารางกิโลเมตร
10. เกาะวานัวลาวา (Vanua Lava) : 334 ตารางกิโลเมตร
11. เกาะซันตามาเรีย (Santa Maria) : 328 ตารางกิโลเมตร
12. เกาะมาเอโว (Maéwo) : 304 ตารางกิโลเมตร
13. เกาะมาโล (Malo) : 180 ตารางกิโลเมตร) และ
14. เกาะอะนาตอม (Anatom) หรือ อาเนติอุม (Aneityum) : 159 ตารางกิโลเมตร

เกาะส่วนใหญ่เป็นภูเขาสูง เดินเป็นภูเขาไฟมาก่อน มีสภาพอากาศแบบเขตร้อน หรือกึ่งเขตร้อน เมืองที่ใหญ่สุด คือเมืองหลวง ชื่อว่า "พอร์ตวิลา" ตั้งอยู่บนเกาะเอฟาเต และเมืองลูแกงวีล บนเกาะเอสปีรีตูซันตู

จุดที่สูงสุดของวานูอาตู คือภูเขา Tabwemasana มีความสูง 1,879 เมตร (6,158 ฟุต) อยู่บนเกาะเอสปิริตู ซานโต เช่นเดียวกัน

นิเวศวิทยา

วานูอาตูถือเป็นภูมิภาคนิเวศบกที่โดดเด่นแห่งหนึ่ง เรียกว่า "ป่าฝนวานูอาตู" วานูอาตูยังเป็นส่วนหนึ่งของเขตนิเวศออสตราเลเชีย (Australasia ecozone) ซึ่งรวมถึงพื้นที่ใกล้เคียงอย่างนิวแคลิโดเนีย และ หมู่เกาะโซโลมอน รวมทั้งออสเตรเลีย ปาปัวนิวกินี และ นิวซีแลนด์