ในปัจจุบัน พยาธิเข็มหมุดมี 3 สปีชีส์ [5] มนุษย์เป็นเจ้าบ้านของ Enterobius vermicularis (เดิมคือ Oxyuris vermicularis)เท่านั้น [6] ชิมแปนซีเป็นเจ้าบ้านของ Enterobius anthropopitheci ซึ่งมีรูปร่างต่างจากพยาธิเข็มหมุดในมนุษย์[3] Hugot (1983) กล่าวว่ามีอีกสปีชีส์หนึ่ง Enterobius gregorii, ซึ่งเป็นพี่น้องกับ E. vermicularisโดยมีสปิคุลเล็กกว่า[7] แต่ Totkova et al. (2003) กล่าวว่ามีหลักฐานไม่พอ [4] และ Hasagawa et al. (2006) กล่าวว่า E. gregorii เป็นระยะตัวอ่อนของ E. vermicularis.[2][3] ในทางการแพทย์ E. gregorii จะถูกพิจารณาเป็น E. vermicularis[6]