พรมแดนญี่ปุ่น-รัสเซีย (อังกฤษ: Japan–Russia border) เป็นเขตแดนทางทะเลโดยพฤตินัย ที่กั้นน่านน้ำอาณาเขต ของทั้งสองประเทศ ตามข้อมูลของหน่วยงานพรมแดนของรัสเซีย พรมแดนมีความยาว 194.3 กิโลเมตร (120.7 ไมล์)[1]ทั้งสองประเทศไม่มีพรมแดนทางบกร่วมกัน แม้ว่าจะมีขึ้นในช่วงปี ค.ศ. 1905-1945 เมื่อเกาะซาฮาลินถูกแบ่งระหว่างญี่ปุ่นกับจักรวรรดิรัสเซีย (และต่อมาคือสหภาพโซเวียต)