การจัดอันดับมหาวิทยาลัยโดย เดอะการ์เดียน ปี 2008 ได้จัดอันดับมหาวิทยาลัยเอดินบะระไว้ดังนี้

• ที่ 1 ของ UK ทางด้านคอมพิวเตอร์
• ที่ 1 ของ UK ทางด้านฟิสิกส์
• ที่ 2 ของ UK ทางด้านการแพทย์
• ที่ 2 ของ UK ทางด้านสัตวแพทย์
• ที่ 7 ของ UK โดยภาพรวม

การจัดอันดับมหาวิทยาลัยโลกโดย ไทมส์ไฮเออร์เอดูเคชันซัปพลีเมนต์ เมื่อปี ค.ศ. 2005 (The 2005 Times Higher Education Supplement [THES] World University Rankings) จัดอันดับมหาวิทยาลัยเอดินบะระดังนี้:

• ที่ 16 ของโลก ด้านชีวเวช
• ที่ 14 ของโลก จากมุมมองของผู้จ้างงาน
• ที่ 27 ของโลก ด้านศิลปศาสตร์และมนุษยศาสตร์
• ที่ 38 ของโลก ด้านวิทยาศาสตร์
• ที่ 30 ของโลก โดยภาพรวม

การจัดอันดับมหาวิทยาลัยโลกโดย มหาวิทยาลัยเซี่ยงไฮ้ เจียวทง (The Academic Ranking of World Universities 2005 [ARWU]) จัดอันดับมหาวิทยาลัยเอดินบะระดังนี้:

• ที่ 5 ของสหราชอาณาจักร
• ที่ 9 ของยุโรป
• ที่ 47 ของโลก

ปี ค.ศ. 2005 มหาวิทยาลัยได้รับเลือกจากหนังสือพิมพ์ซันเดย์ไทมส์ (สหราชอาณาจักร) เป็นมหาวิทยาลัยสกอตแลนด์แห่งปี (Sunday Times Scottish University of the Year)

ปี ค.ศ. 2006 หนังสือแนะนำมหาวิทยาลัยโดยหนังสือพิมพ์ไทมส์ (สหราชอาณาจักร) (The Times Good University Guide 2006) จัดอันดับมหาวิทยาลัยเอดินบะระเป็นอันดับที่ 5 ของสหราชอาณาจักรในภาพรวม และอันดับที่ 4 ในด้านคุณภาพการเรียนการสอน