การก่อตั้งระบบสหวิทยาลัย (Colleges) เพิ่งริเริ่มได้ไม่นานมานี้ โดยค่อย ๆ เริ่มการประสานงานกันตั้งแต่ปี 2006 จนเป็นรูปธรรมมากขึ้นในปีถัดมา และมีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างการบริหารใหม่อีกครั้งในปี 2017[3][4] ในปัจจุบัน มีสถาบันวิจัย คณะ และศูนย์ต่าง ๆ เข้ามาอยู่ภายในสหวิทยาลัยทั้ง 7 แห่ง และคาดว่าระบบสหวิทยาลัยนี้จะเข้ามามีบทบาทสำคัญในการบริหารการศึกษาต่อไป เพื่อให้การวิจัยและการเรียนการสอนในสาขาวิชาที่ใกล้เคียงกันมีการร่วมมือ และแบ่งสรรการใช้ทรัพยาการร่วมกัน โดยเฉพาะบุคลากรทางวิชาการ ให้มีประสิทธิภาพ ก่อให้เกิดความก้าวหน้าทางวิชาการและมุ่งสู่ความเป็นเลิศต่อไป ปัจจุบันประกอบด้วย

• สหวิทยาลัยสุขภาพและการแพทย์ (ANU College of Health and Medicine) ประกอบด้วย สำนักวิชาแพทยศาสตร์ บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านการแพทย์ จอห์น เคอร์ติน บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านสุขภาพประชากร และบัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านจิตวิทยา

• สหวิทยาลัยวิทยาศาสตร์ (ANU College of Science) ประกอบด้วย ศูนย์ความตระหนักสาธารณะทางวิทยาศาสตร์แห่งชาติ สำนักวิชาสิ่งแวดล้อมและสังคมเฟนเนอร์ สถาบันวิจัยทางคณิตศาสตร์ บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านดาราศาสตร์และฟิสิกส์ดาราศาสตร์ บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านชีววิทยา บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านเคมี บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านวิทยาศาสตร์พื้นพิภพ และบัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านฟิสิกส์และวิศวกรรมศาสตร์

• สหวิทยาลัยวิศวกรรมศาสตร์และวิทยาการคอมพิวเตอร์ (ANU College of Engineering and Computer Science) ประกอบด้วย บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านวิศวกรรมศาสตร์ และบัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านวิทยาการคอมพิวเตอร์
• สหวิทยาลัยธุรกิจและเศรษฐศาสตร์ (ANU College of Business and Economics) ประกอบด้วย บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านการจัดการ บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านการเงิน คณิตศาสตร์ประกันภัย และสถิติ บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านการบัญชี และบัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านเศรษฐศาสตร์

• สหวิทยาลัยเอเชียและแปซิฟิก (ANU College of Asia and the Pacific) ประกอบด้วย สำนักวิชานโยบายสาธารณะครอว์ฟอร์ด สำนักวิชากิจการเอเชียแปซิฟิกคอรัลเบลล์ สำนักวิชาวัฒนธรรม ประวัติศาสตร์ และภาษา สำนักวิชาการควบคุมและธรรมภิบาลโลก และศูนย์ออสเตรเลียว่าด้วยจีนในโลก

• สหวิทยาลัยศิลปศาสตร์และสังคมศาสตร์ (ANU College of Arts and Social Sciences) ประกอบด้วย บัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านสังคมศาสตร์ และบัณฑิตวิทยาลัยการวิจัยด้านมนุษยศาสตร์และศิลปศาสตร์

• สหวิทยาลัยนิติศาสตร์ (ANU College of Law) ประกอบด้วย สำนักวิชานิติศาสตร์ และสำนักวิชาการปฏิบัติงานทางด้านกฎหมาย

นอกจากนี้ ยังมีหน่วยงานด้านวิชาการอื่นๆ (Other Academic Units) ประกอบด้วย ศูนย์ชนพื้นเมืองศึกษาแห่งชาติ (National Centre for Indigenous Studies) สำนักวิชาศึกษาทั่วไป (ANU Wide), สำนักโครงสร้างพื้นฐานด้านการคำนวณแห่งชาติ (National Computational Infrastructure) ศูนย์การศึกษา การเรียนรู้ และการสอนในระดับอุดมศึกษา (Centre for Higher Education, Learning and Teaching) และสถาบันเพศภาวะ (Gender Institute) อีกทั้งยังมีสถาบัน ศูนย์ สำนักวิชา และหน่วยย่อยๆ ในแต่ละสหวิทยาลัยอีกนับสิบแห่ง เพื่อขับเคลื่อนและส่งเสริมคุณภาพของการวิจัยเฉพาะทางในแต่ละสาขาวิชา