หลังการรบที่เซกิงาฮาระ อิเอยาสุก็สั่งให้โคบายาคาวะ เข้าโจมตีปราสาทซาวายามะในแคว้นโอมิ ผลลัพธ์คืออิชิดะ มาซาสึกุ อิชิดะ มาซาซุมิ และนางโคเงะสึอิน เสียชีวิตในการรบ

โคนิชิ ยูกินากะ ถูกจับได้ที่เขาอิบูกิโดยทหารของทาเกะนากะ ชิเงะคาโดะ ส่วนในเกียวโต ทหารของโทกุงาวะก็ไปจับกุมอันโกคุจิ เอ๊กเค ที่กำลังซ่อนตัวอยู่ ทางด้านมิตสึนาริ ก็ได้หลบหนีไปตามสถานที่ต่าง ๆ แต่แล้วเขาก็ถูกทหารของทานากะ โยชิมาสะ จับกุมตัวได้ที่ถ้ำแห่งหนึ่งใกล้กับหมู่บ้านทากาโทกิ สุดท้ายมิตสึนาริ, โคนิชิ และเอ๊กเค ก็ถูกประหารชีวิต

ส่วนทางอุคิตะ ฮิเดอิเอะ ก็ถูกเนรเทศไปยังเกาะฮาจิโจจิมะ และมีการสงบศึกระหว่างตระกูลโทกุงาวะกับตระกูลโทโยโตมิ ต่อมาอิเอยาสุก็ได้จัดตั้งรัฐบาลโชกุน และจัดตั้งเมืองหลวงใหม่ที่เอโดะ