ในส่วนนี้จะจำแนกโรงเรียนในจังหวัดสมุทรสาครตามอำเภอที่ตั้งของโรงเรียน โดยสีพื้นหลังของแต่ละแถวแสดงสังกัดของโรงเรียน

•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสมุทรสาคร (สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน)
•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 10 (สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน)
•   โรงเรียนสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน
•   โรงเรียนสังกัดองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น

โรงเรียนในอำเภอเมืองสมุทรสาคร

• โรงเรียนสมุทรสาครบูรณะ [4]
• โรงเรียนสมุทรสาครวิทยาลัย [5]
• โรงเรียนสมุทรสาครวุฒิชัย [6]
• โรงเรียนเฉลิมพระเกียรติสมเด็จพระศรีนครินทร์ สมุทรสาคร
• โรงเรียนพันท้ายนรสิงห์วิทยา
• โรงเรียนอันนาลัย
• โรงเรียนมหาชัยคริสเตียนวิทยา
• โรงเรียนเทศบาลวัดแหลมสุวรรณาราม (วัฒนรวมวิทยา)
• โรงเรียนเทศบาลวัดตึกมหาชยาราม (สมุทรคุณากร)
• โรงเรียนเทศบาลบ้านมหาชัย (อนุกูลราษฎร์)
• โรงเรียนเทศบาลวัดเจษฎาราม (เชยวิทยาทาน)
• โรงเรียนเทศบาลวัดโกรกกราก (กรับวิทยาทาน)
• โรงเรียนเทศบาลวัดช่องลม (เปี่ยมวิทยาคม)
• โรงเรียนวัดป้อมวิเชียรโชติการาม
• โรงเรียนบ้านอ้อมโรงหีบ
• โรงเรียนวัดพันธุวงษ์
• โรงเรียนหลวงแพทย์โกศลอุปถัมภ์
• โรงเรียนวัดบางปลา
• โรงเรียนวัดศิริมงคล
• โรงเรียนวัดเกาะ (สำลีราษฎร์รังสรรค์)
• โรงเรียนศรีทัศน์ดำรงวิทย์
• โรงเรียนวัดราษฎร์รังสรรค์
• โรงเรียนบ้านบางน้ำจืด
• โรงเรียนวัดโพธิ์แจ้
• โรงเรียนเทพนรรัตน์ (อู๋ไพจิตรเรียบร้อยเจริญ)
• โรงเรียนบ้านบางปิ้ง
• โรงเรียนบ้านหนองหาดใหญ่
• โรงเรียนสมฤดีสมุทรสาคร
• โรงเรียนทานตะวันไตรภาษา
• โรงเรียนฐานเทคโนโลยี
• โรงเรียนอนุบาลสมุทรสาคร
• โรงเรียนวัดบางปิ้ง (บริษัทเกลือไทยสงเคราะห์) [7]
• โรงเรียนวัดคลองครุ
• โรงเรียนวัดศรีเมือง
• โรงเรียนบ้านท่าทราย (พวงสำลีราษฎร์อนุสรณ์)
• โรงเรียนบ้านยกกระบัตร
• โรงเรียนอนุสรณ์ศุภมาศ [8]
• โรงเรียนอนุบาลต้นกล้า
• โรงเรียนวัดใหญ่บ้านบ่อ (บ้านบ่อราษฎรบำรุง)
• โรงเรียนวัดบางขุด (อุ่นพิทยาคาร)
• โรงเรียนวัดใต้บ้านบ่อ [9]
• โรงเรียนวัดกระซ้าขาว
• โรงเรียนวัดบางกระเจ้า
• โรงเรียนวัดปากบ่อ (เหลืองราษฎร์บำรุง)
• โรงเรียนวัดน่วมกานนท์
• โรงเรียนบ้านชายทะเลบางกระเจ้า
• โรงเรียนวัดวิสุทธาราม
• โรงเรียนวัดเกตุมดีศรีวราราม
• โรงเรียนเมืองสมุทรสาคร
• โรงเรียนวัดบางพลี (หงส์ร่วมราษฎร์รังสรรค์)
• โรงเรียนบ้านคลองซื่อ
• โรงเรียนอนุบาลสมฤดี
• โรงเรียนวัดบางน้ำวน (รอดพิทยาคม)
• โรงเรียนบ้านนาโคก (นาเกลือสัมพันธ์)
• โรงเรียนปัจจันตาราม
• โรงเรียนวัดกาหลง (พึ่งสุนทรอุทิศ)
• โรงเรียนบ้านชายทะเลกาหลง
• โรงเรียนวัดนาขวาง
• โรงเรียนวัดราษฎร์ธรรมาราม
• โรงเรียนเอกชัย
• โรงเรียนเจริญศิลป์ศึกษา
• โรงเรียนวัดบางหญ้าแพรก
• โรงเรียนสมุทรมณีรัตน์
• โรงเรียนวัดใหญ่จอมปราสาท
• โรงเรียนวัดชีผ้าขาว (ประชานุเคราะห์)
• โรงเรียนวัดเจริญสุขาราม
• โรงเรียนสหกรณ์นิคมเกลือ
• โรงเรียนวัดสามัคคีศรัทธาราม
• โรงเรียนสหกรณ์กสิกรรมชายทะเล
• โรงเรียนบ้านโคก
• โรงเรียนวัดโสภณาราม (ปลั่งร่วมราษฎร์บำรุง)
• โรงเรียนวัดศรีสุทธาราม
• โรงเรียนวัดโคกขาม (นรสิงห์อนุสรณ์)
• โรงเรียนวัดบ้านไร่ (ประชานุกูล)
• โรงเรียนบ้านชายทะเลโคกขาม มิตรภาพที่ 95
• โรงเรียนบ้านสันดาบ
• โรงเรียนสามชัยวิเทศศึกษา
• โรงเรียนอนุบาลน้อมจิตต์
• โรงเรียนอนุบาลช้างน้อย
• โรงเรียนนานาชาตินอริชกรุงเทพ
• โรงเรียนอัสสัมชัญหลักสูตรภาษาอังกฤษ

โรงเรียนในอำเภอกระทุ่มแบน

• โรงเรียนกระทุ่มแบน (วิเศษสมุทคุณ) [10]
• โรงเรียนวัดนางสาว(ถาวรราษฎร์บำรุง) [11]
• โรงเรียนกุศลวิทยา
• โรงเรียนอ้อมน้อยโสภณชนูปถัมภ์ [12]
• โรงเรียนเทศบาลวัดดอนไก่ดี (สังวรจันทสรราษฎรวิทยา)
• โรงเรียนเทศบาลศรีบุณยานุสสรณ์ [13]
• โรงเรียนเทศบาลอ้อมน้อย
• โรงเรียนอนุบาลเทศบาลอ้อมน้อย
• โรงเรียนวังนกไข่
• โรงเรียนบ้านปลายคลองน้อย
• โรงเรียนวัดหนองนกไข่
• โรงเรียนวัดท่ากระบือ (ท่ากระบือพิทยาคาร)
• โรงเรียนวัดบางยาง (บางยางพิทยาคาร)
• โรงเรียนบ้านท้องคุ้ง
• โรงเรียนวัดอ่างทอง (อ่างทองพิทยาคาร)
• โรงเรียนวัดอ้อมน้อย (มิตรครูราษฎร์รังสรรค์) [14]
• โรงเรียนบ้านคลองแค [15]
• โรงเรียนวัดศรีสำราญราษฎร์บำรุง (แช่มประชาอุทิศ) [16]
• โรงเรียนปัญจพรพิทยา
• โรงเรียนอนุบาลบ้านทอฝัน
• โรงเรียนวัดนางสาว (ถาวรราษฎร์บำรุง)
• โรงเรียนวัดสุวรรณรัตนาราม
• โรงเรียนบ้านดอนไก่ดี
• โรงเรียนวัดท่าเสา (อาทรราษฎร์อุปถัมภ์)
• โรงเรียนบ้านคลองกระทุ่มแบน
• โรงเรียนวัดราษฎร์บำรุง
• โรงเรียนวัดใหม่หนองพะอง
• โรงเรียนอนุบาลยุวธัช
• โรงเรียนประชินนุสรณ์
• โรงเรียนบ้านปล่องเหลี่ยม

โรงเรียนในอำเภอบ้านแพ้ว

• โรงเรียนวัดธรรมจริยาภิรมย์
• โรงเรียนวัดหลักสี่พิพัฒน์ราษฎร์อุปถัมภ์
• โรงเรียนหลักสองส่งเสริมวิทยา
• โรงเรียนหลวงสินธุ์ราษฎร์รังสฤษฏ์
• โรงเรียนบ้านแพ้ววิทยา (ตี่ตง)
• โรงเรียนอนุบาลบ้านแพ้ว (วันครู 2500)
• โรงเรียนวัดชัยมงคล
• โรงเรียนบ้านดอนไผ่ (อุดม-สอางค์อุ่นสุวรรณ)
• โรงเรียนวัดหนองสองห้อง (สายชนูปถัมภ์)
• โรงเรียนวัดโรงเข้
• โรงเรียนวัดธรรมโชติ
• โรงเรียนบ้านโรงเข้
• โรงเรียนวัดยกกระบัตร (ชุบราษฎร์นุสรณ์)
• โรงเรียนทำนบแพ้ว
• โรงเรียนวัดหนองบัว
• โรงเรียนวัดดอนโฆสิตาราม
• โรงเรียนวัดหลักสองราษฎร์บำรุง
• โรงเรียนวัดคลองตันราษฎร์บำรุง
• โรงเรียนวัดเจ็ดริ้ว
• โรงเรียนบ้านคลองตัน
• โรงเรียนบ้านรางสายบัว
• โรงเรียนวัดธรรมเจดีย์ศรีพิพัฒน์
• โรงเรียนวัดกระโจมทอง
• โรงเรียนไทยรัฐวิทยา 9 (วัดใหม่ราษฎร์นุกูล)
• โรงเรียนวัดสวนส้ม (ชื่นสินอนุสสรณ์)
• โรงเรียนทีปังกรวิทยาพัฒน์ (วัดสุนทรสถิต) ในพระราชูปถัมภ์ฯ
• โรงเรียนวัดธัญญารามราษฎร์บำรุง
• โรงเรียนบ้านดำเนินสะดวก (กิมลี้มณีฉาย)
• โรงเรียนบ้านคลองสำโรง
• โรงเรียนบ้านคลองหลวง
• โรงเรียนบ้านเจริญสุข
• โรงเรียนบ้านวังจระเข้
• โรงเรียนวัดราษฎร์ศรัทธากะยาราม
• โรงเรียนสารสาสน์วิเทศบ้านแพ้ว
• โรงเรียนอัตตาภิวัฒน์
• โรงเรียนวัดหลักสี่ราษฎร์สโมสร