ในส่วนนี้จะจำแนกโรงเรียนในจังหวัดสุพรรณบุรีตามสังกัดของโรงเรียน ได้แก่

• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน (สพฐ.) ตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ จังหวัดสุพรรณบุรีอยู่ในพื้นที่ของเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 9[1] และมีเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาจำนวน 3 เขต[2]
• องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น (อปท.)
• สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน (สช.)
  
• โรงเรียนสาธิตของมหาวิทยาลัย ซึ่งอยู่ในสังกัดของมหาวิทยาลัยนั้น ๆ
  
• โรงเรียนกีฬาในสังกัดมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติและโรงเรียนสังกัดอื่น ๆ

สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน

จังหวัดสุพรรณบุรีมีโรงเรียนสังกัด สพฐ. จำนวน 430 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นโรงเรียนมัธยมศึกษาสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 9 (สพม.9) จำนวน 32 โรงเรียน โรงเรียนสังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรีทั้ง 3 เขตจำนวน 397 โรงเรียน[3] และโรงเรียนสังกัดสำนักบริหารงานการศึกษาพิเศษ 1 โรงเรียน[4]

เขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาของจังหวัดสุพรรณบุรีแบ่งดังนี้[2]

• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 1 (สพป.สุพรรณบุรี เขต 1) ประกอบด้วยอำเภอเมืองสุพรรณบุรี อำเภอบางปลาม้า และอำเภอศรีประจันต์
• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 2 (สพป.สุพรรณบุรี เขต 2) ประกอบด้วยอำเภอดอนเจดีย์ อำเภอสองพี่น้อง และอำเภออู่ทอง
• สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรี เขต 3 (สพป.สุพรรณบุรี เขต 3) ประกอบด้วยอำเภอด่านช้าง อำเภอเดิมบางนางบวช อำเภอสองพี่น้อง และอำเภอหนองหญ้าไซ

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 9

จังหวัดสุพรรณบุรีอยู่ในเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาเขต 9 ร่วมกับจังหวัดนครปฐม[1] และมีโรงเรียนในสังกัดจำนวน 32 โรงเรียน โดยแบ่งเป็น 4 สหวิทยาเขตได้แก่[5]

• สหวิทยาเขตทวารวดี รับผิดชอบโรงเรียนในพื้นที่อำเภอสองพี่น้องและอำเภออู่ทอง
• สหวิทยาเขตนเรศวร รับผิดชอบโรงเรียนในพื้นที่อำเภอเมืองสุพรรณบุรีและอำเภอบางปลาม้า
• สหวิทยาเขตพุเตย รับผิดชอบโรงเรียนในพื้นที่อำเภอด่านช้าง อำเภอเดิมบางนางบวช และอำเภอหนองหญ้าไซ
• สหวิทยาเขตสุพรรณกัลยา รับผิดชอบโรงเรียนในพื้นที่อำเภอดอนเจดีย์ อำเภอศรีประจันต์ และอำเภอสามชุก

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรีเขต 1

สพป.สุพรรณบุรี เขต 1 มีพื้นที่ครอบคลุม 3 อำเภอทางตะวันตกของจังหวัด ได้แก่อำเภอเมืองสุพรรณบุรี อำเภอบางปลาม้า และอำเภอศรีประจันต์ มีโรงเรียนในความรับผิดชอบจำนวน 135 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นอำเภอเมืองสุพรรณบุรี 57 โรงเรียน อำเภอบางปลาม้า 47 โรงเรียน และอำเภอศรีประจันต์ 31 โรงเรียน

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรีเขต 2

สพป.สุพรรณบุรี เขต 2 มีพื้นที่ครอบคลุม 3 อำเภอทางตอนใต้ของจังหวัด ได้แก่อำเภอดอนเจดีย์ อำเภอสองพี่น้อง และอำเภออู่ทอง มีโรงเรียนในความรับผิดชอบจำนวน 134 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นอำเภอสองพี่น้อง 54 โรงเรียน อำเภออู่ทอง 53 โรงเรียน และอำเภอดอนเจดีย์ 27 โรงเรียน

สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาสุพรรณบุรีเขต 3

สพป.สุพรรณบุรี เขต 3 มีพื้นที่ครอบคลุม 4 อำเภอทางตอนใต้ของจังหวัด ได้แก่อำเภอด่านช้าง อำเภอเดิมบางนางบวช อำเภอสามชุก และอำเภอหนองหญ้าไซ มีโรงเรียนในความรับผิดชอบจำนวน 128 โรงเรียน โดยแบ่งเป็นอำเภอเดิมบางนางบวช 42 โรงเรียน อำเภอด่านช้าง 36 โรงเรียน อำเภอสามชุก 26 โรงเรียน และอำเภอหนองหญ้าไซ 24 โรงเรียน

สำนักบริหารงานการศึกษาพิเศษ

จังหวัดสุพรรณบุรีมีโรงเรียนสังกัดสำนักบริหารงานการศึกษาพิเศษ 1 โรงเรียน ได้แก่โรงเรียนสุพรรณบุรีปัญญานุกูล ตั้งอยู่ที่ตำบลทับตีเหล็ก อำเภอเมืองสุพรรณบุรี[4]

องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น

จังหวัดสุพรรณบุรีมีโรงเรียนสังกัดองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น 17 โรงเรียน องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นที่มีโรงเรียนในความรับผิดชอบได้แก่เทศบาลเมืองสองพี่น้อง (4 โรงเรียน) เทศบาลเมืองสุพรรณบุรี (6 โรงเรียน) เทศบาลตำบล 5 แห่ง และองค์การบริหารส่วนตำบล 2 แห่ง[6]

สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชน

โรงเรียนเอกชนในจังหวัดสุพรรณบุรีซึ่งสังกัดสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาเอกชนมีจำนวน 27 โรงเรียน[7]

โรงเรียนสาธิตมหาวิทยาลัยในกำกับสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา

จังหวัดสุพรรณบุรีมีโรงเรียนสาธิต 1 โรงเรียนได้แก่โรงเรียนสาธิตละอออุทิศ สุพรรณบุรี อยู่ในสังกัดมหาวิทยาลัยสวนดุสิต ตั้งอยู่ที่ตำบลโคกโคเฒ่า อำเภอเมืองสุพรรณบุรี เปิดสอนตั้งแต่ระดับชั้นเตรียมอนุบาลถึงประถมศึกษา[8]

โรงเรียนกีฬาสังกัดมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติ

โรงเรียนกีฬาจังหวัดสุพรรณบุรี เป็นส่วนราชการในสังกัดมหาวิทยาลัยการกีฬาแห่งชาติ ตั้งอยู่ที่ตำบลรั้วใหญ่ อำเภอเมืองสุพรรณบุรี จัดการศึกษาในระดับมัธยมศึกษาควบคู่กับการฝึกซ้อมกีฬา[9]