ปลาในวงศ์ปลากระเบนธงพบทั้งหมดประมาณ 70 ชนิด ที่พบในประเทศไทยมีทั้งหมด 21 ชนิด อาทิ [2]

• ที่พบในน้ำจืด
  • ปลากระเบนแม่น้ำโขง (Dasyatis laosensis)
  • ปลากระเบนราหู (Himantura chaophraya หรือ polylepis)
  • ปลากระเบนแม่กลอง (Himantura kittipongi)
  • ปลากระเบนขาว (Himantura signifer)
• ที่พบในน้ำกร่อยหรือทะเล
  • ปลากระเบนบัว (Himantura bleekeri)
  • ปลากระเบนแมลงวัน (Himantura gerrardi)
  • ปลากระเบนลายเสือ (Himantura oxyrhynchus)
  • ปลากระเบนชายธง (Pastinachus sephen)
  • ปลากระเบนทอง (Taeniura lymma)