สภาเด็กและเยาวชนจังหวัดสุราษฎร์ธานี แบ่งการบริหารงานออกเป็น 4 ด้าน ได้แก่ ด้านอำนวยการ, ด้านกิจการสภา, ด้านบริหารทั่วไป และด้านสัมพันธ์ชุมชน มีคณะผู้บริหาร ประกอบด้วย ประธานสภา 1 คน รองประธานสภา 4 คน เยาวชนที่ปรึกษา 1 คน ผู้ทรงคุณวุฒิ 2 คน ผู้ตรวจการสภา 3 คน เลขานุการสภา 1 คน และผู้ช่วยเลขานุการสภา 3 คน