สโมสรฟุตบอลวัดโบสถ์ ซิตี้ ทำการสมัครเข้าเป็นสมาชิกสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทย เมื่อวันที่ 2 สิงหาคม 2561 และเข้าร่วมการแข่งขันไทยแลนด์ อเมเจอร์ลีก ฤดูกาล 2561 วัดโบสถ์ ซิตี้ได้ตำแหน่งชนะเลิศโซนภาคเหนือตอนล่างหลังจากชนะนอร์ทเทิร์น ตาก ยูไนเต็ดด้วยการดวลลูกโทษ 9–8 หลังจากเสมอกันในเวลา 1–1[1] และเข้าชิงชนะเลิศโซนภาคเหนือกับแม่โจ้ ยูไนเต็ด แต่แม่โจ้ ยูไนเต็ดเป็นฝ่ายชนะ 2–1 ทำให้วัดโบสถ์ ซิตี้ได้เพียงรองชนะเลิศเท่านั้น[2] แต่ยังได้สิทธิ์เลื่อนชั้นสู่ไทยลีก 4

สโมสรฟุตบอลวัดโบสถ์ ซิตี้ได้เจรจาร่างข้อตกลงร่วมกับมหาวิทยาลัยราชภัฏพิบูลสงคราม อำเภอเมืองพิษณุโลก เพื่อขอใช้สนามแข่งขันไทยลีก 4 และขอความร่วมมือพัฒนานักเตะในสโมสร[3] ในขณะที่สนามเหย้าจริงของสโมสรได้วางแผนก่อสร้างในเขตพื้นที่อำเภอวัดโบสถ์ ใกล้กับถนนพิษณุโลก–อุตรดิตถ์ โดยเช่าที่ดินขนาด 16 ไร่จากญาติของทีมงานในสโมสร[4]