อุปกรณ์สังเกตการณ์เกือบทั้งหมดของ ESO ตั้งอยู่ที่ประเทศชิลี เนื่องจากต้องการมองเห็นท้องฟ้าซีกใต้อย่างชัดเจน โดยตั้งอยู่ในทะเลทราย Atacama อันเป็นหนึ่งในสถานที่ที่แห้งแล้งที่สุดบนโลก มีหอดูดาวทั้งสิ้น 3 แห่งคือ ที่ลาซีญา (La Silla) พารานัล (Paranal) และ Llano de Chajnantor

ลาซิยา

หอดูดาวลาซิยา

ปารานาล

หอดูดาวปารานาล (Paranal)

ยาโน เด ชานันตอร์

หอดูดาวยาโน เด ชานันตอร์ (Llano de Chajnantor)