ในอดีต เขตปกครองคณะสงฆ์ตำบลคุ้งตะเภา มีอำนาจหน้าที่ควบคุมดูแลพระภิกษุสงฆ์เฉพาะในเขตตำบลคุ้งตะเภาเท่านั้น แต่ในปัจจุบัน ตั้งแต่ปี พ.ศ. 2550 เป็นต้นมา อาณาเขตการปกครองสงฆ์ได้เพิ่มไปถึงเขตตำบลผาจุก (อำเภอเมืองอุตรดิตถ์) บางส่วน

ปัจจุบัน มีวัดในเขตปกครองคณะสงฆ์ทั้งหมด 7 วัด และ 2 สำนักสงฆ์ เรียงตามลำดับปีได้รับอนุญาตให้ตั้งวัดดังนี้

วัดมีวิสุงคามสีมา

วัดมีวิสุงคามสีมา (อุโบสถ) มีจำนวน 5 วัด คือ

1. วัดคุ้งตะเภา
2. วัดป่ากล้วย
3. วัดป่าสักเรไร
4. วัดหาดเสือเต้น
5. วัดใหม่เจริญธรรม

วัดไม่มีวิสุงคามสีมา

วัดไม่มีวิสุงคามสีมา มีจำนวน 2 วัด คือ

1. วัดหนองปล้อง
2. วัดบ่อพระ

สำนักสงฆ์

สำนักสงฆ์ มีจำนวน 2 วัด คือ

1. ที่พักสงฆ์บ้านเด่นกระต่าย (ตำบลผาจุก)
2. ที่พักสงฆ์บ้านหนองบัว (ตำบลผาจุก)