เซลีโก กอมชิช เข้าสู่การเมืองในปี ค.ศ.1998 และ ในปี ค.ศ.2000 เขาก็ลงท้าชิงตำแหน่งนายกเทศมนตรีเมืองโนโวซาราเยโวจากพรรคสังคมประชาธิปไตยบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนาหรือSDP และได้เป็นนายกเทศมนตรีในปี ค.ศ.2001 - 2006 และในช่วงนั้นเขาได้ลงท้าชิงหัวหน้าพรรคSDPและชนะเป็นหัวหน้าพรรคSDP ต่อมาในปี ค.ศ.2006 เขาลงท้าชิงตำแหน่งประธานาธิบดีและได้รับการแต่งตั้งเป็นประธานคณะประธานาธิบดี โดยเขาสาบานตนในวันที่6 พฤศจิกายน 2006

ต่อมาหลังความขัดแย้งด้านอุดมการณ์ระหว่างเซลีโก กอมชิช กับ เนอร์มิน นิกชิช เขาก็ลาออกจากหัวหน้าพรรคSDP และส่งผลให้ในการเลือกตั้ง ปี ค.ศ.2014 เขาไม่ได้ลงสมัครเลือกตั้ง ในช่วงปี ค.ศ.2013 เขาจัดตั้งกลุ่มการเมืองที่เรียกว่า แนวร่วมประชาธิปไตยแห่งบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนา ซึ่งเป็นกลุ่มการเมืองฝ่ายซ้ายที่มีอิทธิพลต่อการปกครองประเทศบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนา และ เป็นคู่แข่งสำคัญของพรรคSDAและHDZ ของอดีตสมาชิกประธานาธิบดีดรากัน โชวิชและ ประธานคณะประธานาธิบดีบาคีร์ อีเซตเบกอวิชในเดือนตุลาคม ปี ค.ศ.2018 ในการเลือกตั้งเขาท้าชิงตำแหน่งประธานาธิบดีกับดรากัน โชวิช และชนะการเลือกตั้ง เป็นประธานและสมาชิกประธานาธิบดีคนปัจจุบันของบอสเนียและเฮอร์เซโกวีนา