ตำบลดอนฉิมพลี อยู่ในเขตของอำเภอบางน้ำเปรี้ยว เป็นตำบลเก่าแก่ ในปี พ.ศ. 2449 กระทรวงมหาดไทยได้ยุบรวมพื้นที่ตำบล เนื่องจากตำบลที่มีมากเกินไป ได้ยุบรวมพื้นที่ตำบลดอนฉิมพาลี ตำบลคลอง 16 และตำบลคลอง 17 แล้วจัดตั้งเป็น "ตำบลดอนฉิมพาลี"[2] หรือตำบลดอนฉิมพลีในปัจจุบัน ตามประกาศกระทรวงมหาดไทยลงวันที่ 26 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2449 ให้มีผลตั้งแต่วันที่ 3 มีนาคม ปีเดียวกัน

เทศบาลตำบลดอนฉิมพลี แรกเริ่มก่อตั้งตามประกาศกระทรวงลงวันที่ 14 พฤษภาคม พ.ศ. 2499 โดยจัดตั้งท้องถิ่นบางส่วนของตำบลดอนฉิมพลี ซึ่งเป็นบริเวณที่ตั้งของตลาดคลอง 16 ขึ้นเป็น สุขาภิบาลดอนฉิมพลี[3] อำเภอบางน้ำเปรี้ยว จังหวัดฉะเชิงเทรา โดยให้มีผลตั้งแต่วันที่ 30 พฤษภาคม ปีเดียวกัน โดยครอบคลุมพื้นที่บางส่วนของตำบลดอนฉิมพลี อำเภอบางน้ำเปรี้ยว จังหวัดฉะเชิงเทรา นับเป็นสุขาภิบาลลำดับที่ 2 ของอำเภอ

ชุมชนบริเวณสุขาภิบาลดอนฉิมพลีนั้น มีความเจริญอย่างรวดเร็วเป็นอย่างมาก กระทรวงมหาดไทยจึงให้ใช้พระราชกฤษฎีกา ให้ใช้พระราชบัญญัติควบคุมอาคาร พ.ศ. 2522 บังคับในเขตสุขาภิบาลดอนฉิมพลี[4] เนื่องจากมีการขยายตัวทั้งในด้านการก่อสร้างอาคารและการผังเมือง ตามประกาศกระทรวงมหาดไทยลงวันที่ 9 กันยายน พ.ศ. 2533 โดยให้มีผลตั้งแต่วันที่ 24 กันยายน ปีเดียวกัน

ต่อมาในปี พ.ศ. 2542 ได้มีพระราชบัญญัติเปลี่ยนแปลงฐานะสุขาภิบาลทั่วประเทศเป็นเทศบาลตำบล ตามประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 116 ตอนที่ 9 ลงวันที่ 24 กุมภาพันธ์ 2542 มีผลใช้บังคับ เมื่อวันที่ 25 พฤษภาคม 2542 สุขาภิบาลดอนฉิมพลี จึงเปลี่ยนแปลงฐานะเป็นเทศบาลตำบลดอนฉิมพลี[5] นับตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา ซึ่งตามหลักการและเหตุผลการประกาศใช้พระราชบัญญัติฉบับนี้ ก็เพื่อให้สอดคล้องกับบทบัญญัติของรัฐธรรมนูญแห่งราชอาณาจักรไทย พ.ศ. 2540 และเป็นการกระจายอำนาจให้แก่องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น