เพนกวินกาลาปาโกส (อังกฤษ: Galápagos penguin; Spheniscus mendiculus) เป็นเพนกวินท้องถิ่นของหมู่เกาะกาลาปาโกส เป็นเพนกวินชนิดเดียที่พบได้เหนือเส้นศูนย์สูตร[2] น้ำเย็นของกระแสน้ำฮัมโบลต์และกระแสน้ำครอมเวลล์ทำให้เพนกวินชนิดนี้มีชีวิตอยู่ได้แม้จะอยู่ที่เส้นละติจูดเขตร้อน เพนกวินกาลาปาโกสเป็นหนึ่งในสกุลเพนกวินลาย ขณะที่สปีชีส์อื่นส่วนมากจะมีชีวิตอยู่แถบชายฝั่งของทวีปแอฟริกาและแผ่นดินใหญ่ของอเมริกาใต้