1 เยื่อหุ้มชั้นนอก
2 ช่องว่างระหว่างเยื่อหุ้ม
3 ลาเมลลา
4 ดีเอ็นเอของไมโทคอนเดรีย
5 เมตริกซ์กรานูล
6 ไรโบโซม
7 เอทีพีซินเทสในไมโทคอนเดรียน เมทริกซ์ หรือ แมทริกซ์ (อังกฤษ: Mitochondrial matrix) เป็นพื้นที่ว่างภายในเยื่อหุ้มชั้นใน คำว่า "matrix" นั้นมีรากมาจากข้อเท็จจริงที่ว่าพื้นที่ว่างนี้มีความหนืด (viscous) เมื่อเทียบกับไซโทพลาซึมที่ค่อนข้างจะเหลวแบบสารละลาย (aqueous) เมทริกซ์ของไมโทคอนเดรียนั้นประกอบด้วย DNAของไมโทคอนเดรีย, ไรโบโซมของไมโทคอนเดรีย, เอนไซม์, โมเลกุลสารอินทรีย์ขนาดเล็ก, โคแฟกเตอร์นิวคลีโอไทด์ (nucleotide cofactors) และไอออนอนินทรีย์ เอนไซม์ต่าง ๆ ภายในเมทริกซ์ช่วยให้ปฏิกิริยาในการผลิต ATP ดำเนินไปได้ง่ายดายขึ้น เช่น ปฏิกิริยาวัฒจักรกรดซิตริก, ออกซิดีทีฟฟอสฟอรีเลชั่น, การออกซิเดชั่นของไพรูเวต และเบตาออกซิเดชั่นของกรดไขมัน[1]