เลโอนอร์แห่งอารากอนเสด็จพระราชสมภพเมื่อวันที่ 1 กุมภาพันธ์ ค.ศ. 1402 เป็นพระราชธิดาของพระเจ้าเฟร์นันโดที่ 1 แห่งอารากอน กับเลโอนอร์แห่งอัลบูร์เกร์เก ทรงสูญเสียพระบิดาขณะพระชนมายุ 14 พรรษา พระเจ้าอัลฟอนโซที่ 4 พระเชษฐาของพระองค์ได้สืบราชสมบัติ พระราชมารดาของพระองค์ได้จัดแจงให้พระองค์อภิเษกสมรสกับพระเจ้าดูวาร์ตึแห่งโปรตุเกส การอภิเษกสมรสเกิดขึ้นเมื่อวันที่ 22 กันยายน ค.ศ. 1428 ทั้งคู่มีพระราชโอรสธิดาด้วยกัน 9 พระองค์ แต่มี 4 พระองค์สิ้นพระชนม์ในวัยเยาว์

วันที่ 14 สิงหาคม ค.ศ. 1433 พระสวามีของพระองค์ได้สืบทอดตำแหน่งเป็นกษัตริย์แห่งโปรตุเกสและในวันเดียวกันนั้น ฌูเอา พระราชโอรสพระองค์ใหญ่ของทั้งคู่ได้สิ้นพระชนม์ เลโอนอร์เป็นพระราชินีที่ไม่มีบทบาททางการเมืองทำให้พระองค์ไม่ค่อยเป็นที่นิยม เป็นพระราชินีได้เพียง 5 ปีพระสวามีก็สวรรคตด้วยกาฬโรคในวันที่ 13 กันยายน ค.ศ. 1438 ขณะที่เลโอนอร์กำลังตั้งครรภ์ ในพินัยกรรมพระองค์ได้แต่งตั้งพระนางเป็นผู้สำเร็จราชการแทนพระองค์ ราชสำนักโปรตุเกสได้ทำตามพระประสงค์ของพระองค์ ทว่าด้วยความอ่อนประสบการณ์ สุขภาพที่ไม่สู้ดี และการเป็นชาวอารากอนทำให้พระองค์ไม่เป็นที่นิยม การรับรองตำแหน่งผู้สำเร็จราชการแทนพระองค์จึงก่อให้เกิดจลาจลในลิสบอน ประชาชนต้องการให้อิงฟังตึเปดรู ดยุคแห่งกูอิงบรา พระอนุชาของพระเจ้าดูวาร์ตึเป็นผู้สำเร็จราชการแผ่นดิน การเจรจาต่อรองยืดเยื้ออยู่หลายเดือน ในช่วงนั้นพระองค์ได้ให้กำเนิดเจ้าหญิงจัวนาแห่งโปรตุเกสและได้สูญเสียฟีลีปาพระราชธิดาพระองค์ใหญ่ที่ประชวรพระวัณโรค

ท้ายที่สุดราชสำนักได้แต่งตั้งอิงฟังตึเปดรูเป็นผู้สำเร็จราชการแผ่นดินเพียงหนึ่งเดียว เลโอนอร์ถูกเนรเทศไปอยู่ที่กัสติยาในเดือนธันวาคม ค.ศ. 1440 พระองค์ประชวรหนักและสวรรคตด้วยโรคทางเดินหายใจในวันที่ 19 กุมภาพันธ์ ค.ศ. 1445