เลโอนอร์มีพระราชโอรสธิดาทั้งสิ้น 9 คน คือ

1. อิงฟังตึฌูเอา สิ้นพระชนม์ในวัยเด็ก
2. อิงฟังตาฟีลีปา สิ้นพระชนม์ในวัยเด็ก
3. พระเจ้าอาฟงซูที่ 5 แห่งโปรตุเกส สืบทอดตำแหน่งต่อจากพระเจ้าดูวาร์ตึเป็นกษัตริย์ลำดับที่สิบสองของโปรตุเกส
4. อิงฟังตามารีอา สิ้นพระชนม์ในวัยเด็ก
5. อิงฟังตึฟือร์นังดู ดยุคแห่งวีเซว พระบิดาของพระเจ้ามานูเอลที่ 1 แห่งโปรตุเกส
6. อิงฟังตาลียูโนร์ อภิเษกสมรสกับจักรพรรดิฟรีดริชที่ 3 แห่งจักรวรรดิโรมันอันศักดิ์สิทธิ์
7. อิงฟังตึดูวาร์ตึ สิ้นพระชนม์ในวัยเด็ก
8. อิงฟังตากาตารีนา แม่ชี
9. อิงฟังตาจัวนาแห่งโปรตุเกส อภิเษกสมรสกับพระเจ้าเอนริเกที่ 4 แห่งกัสติยา