คณะสีในอดีต 5 คณะสีดังต่อไปนี้ โดยตั้งชื่อเป็นเมืองต่างๆในประเทศไทย ปัจจุบันได้มีการเปลี่ยนแปลงชื่อคณะ เมื่อปี ๒๕๖๓.

• คณะรัตนโกสินทร์ มีสีประจำคณะ สีเขียว [] 1."พุทธาสัมฤทธิ์" ความหมาย หลวงพ่อสัมฤทธิ์ พระพุทธรูปประจำโรงเรียน (สีเหลือง)
• คณะ เชียงแสน มีสีประจำคณะ สีม่วง [] 2. "มุนีนันทาจารย์" ความหมาย พระราชนันทาจารย์ องค์อุปถัมภ์โรงเรียน (สีแดง)
• คณะสุโขทัย มีสีประจำคณะ สีเหลือง [] 3. "ศรีกาลพฤกษา" ความหมาย ต้นกัลปพฤกษ์ ต้นไม้ประจำโรงเรียน (สีม่วง)
• คณะอู่ทอง มีสีประจำคณะ สีฟ้า [] 4. "สัมมานรชน" ความหมาย แหล่งสร้างคนดีสีบางซื่อ ผู้มีสัมมาคารวะ (สีแสด)
• คณะอยุธยา มีสีประจำคณะ สีแดง [] 5. "ภูวดลเบญจางค์" ความหมาย พิธีกราบแผ่นดิน ที่นักเรียนปฏิบัติในวันจบการศึกษา (สีฟ้า)