กล้ามเนื้อเฟลกเซอร์ ดิจิทอรุม โปรฟันดัสถูกเลี้ยงโดยเส้นประสาทมีเดียน (median nerve) และเส้นประสาทอัลนา (ulnar nerve) โดยที่

• ด้านใกล้กลาง (medial aspect) ของกล้ามเนื้อนี้ (ซึ่งทำหน้าที่งอนิ้วนางและนิ้วก้อย) เลี้ยงโดยเส้นประสาทอัลนา (C8, T1)
• ด้านข้าง (lateral aspect) ของกล้ามเนื้อนี้ (ซึ่งทำหน้าที่งอนิ้วชี้และนิ้วนาง) เลี้ยงโดยเส้นประสาทมีเดียน โดยผ่านแขนงแอนทีเรียร์อินเตอร์ออสเซียส (C8, T1)

กล้ามเนื้อนี้เป็นกล้ามเนื้อหนึ่งในสองกล้ามเนื้อกลุ่มงอนิ้วมือที่เลี้ยงโดยเส้นประสาทมีเดียน (อีกมัดหนึ่งคือกล้ามเนื้อเฟลกเซอร์ คาร์ไพ อัลนาริส (flexor carpi ulnaris))