ด้านข้างของสถานีสยามทางเข้าสถานีสยาม จากลานพาร์คพารากอนชานชาลาชั้นล่าง สำหรับผู้โดยสารที่ต้องการเดินทางไปยัง สถานีเคหะฯ และ สถานีบางหว้า (มุ่งหน้าไปยังทิศใต้และตะวันออก)ชานชาลาชั้นบน สำหรับผู้โดยสารที่ต้องการเดินทางไปยัง สถานีวัดพระศรีมหาธาตุ และ สถานีสนามกีฬาแห่งชาติ (มุ่งหน้าไปยังทิศเหนือและตะวันตก)

เป็นสถานีแห่งแรกในระบบรถไฟฟ้าบีทีเอส ที่เป็นแบบชานชาลาเกาะกลาง (Central Platform) และมีรถไฟฟ้าวิ่งอยู่ 2 ข้าง (ปัจจุบันในเส้นทางนี้มีอีกสามแห่งคือ สถานีสำโรง สถานีห้าแยกลาดพร้าว และ สถานีวัดพระศรีมหาธาตุ ของสายสุขุมวิท) ซึ่งการก่อสร้างยุ่งยากแต่มีประสิทธิภาพสูง เหมาะสำหรับการเปลี่ยนขบวนรถระหว่างสายสุขุมวิทและสายสีลม และเนื่องจากต้องรองรับผู้โดยสารมากเป็นพิเศษ จึงมีขนาดใหญ่กว่าขนาดสถานีมาตรฐาน กว้าง 21 เมตร ยาว 192 เมตร

ตัวสถานีมี 3 ชั้น ประกอบด้วยชั้นจำหน่ายตั๋ว, ชานชาลาชั้นล่างสำหรับขบวนรถมุ่งหน้า สถานีชิดลม และ สถานีราชดำริ และชานชาลาชั้นบนสำหรับขบวนรถมุ่งหน้า สถานีราชเทวี และ สถานีสนามกีฬาแห่งชาติ ซึ่งในปัจจุบันชั้นจำหน่ายตั๋วถูกแบ่งออกเป็น 2 ส่วน เพื่อให้ทางออกที่ 3 ไปยังห้าง สยามพารากอน และทางออกที่ 4 ไปยังป้ายรถประจำทางหน้าศูนย์การค้า สยามสแควร์วัน สามารถเดินข้ามถนนถึงกันได้

สถานีสยามเป็นสถานีนำร่องในการติดตั้งประตูกั้นชานชาลาแบบครึ่งความสูง ซึ่งปัจจุบันได้ติดตั้งและเปิดใช้งานแล้วทุกชานชาลา [2]

โดยชั้นชานชาลาทั้งชั้นล่างและชั้นบน มีการติดตั้งพัดลมเพดานขนาดใหญ่ (High Volume Low Speed : HVLS) เพื่อเพิ่มการหมุนเวียนอากาศภายในสถานี