อำเภอสิเกาตั้งอยู่ทางทิศตะวันตกเฉียงเหนือของจังหวัด มีอาณาเขตติดต่อกับเขตการปกครองข้างเคียงดังต่อไปนี้

• ทิศเหนือ ติดต่อกับอำเภอคลองท่อม (จังหวัดกระบี่) และอำเภอวังวิเศษ
• ทิศตะวันออก ติดต่อกับอำเภอวังวิเศษ อำเภอเมืองตรัง และอำเภอกันตัง
• ทิศใต้ ติดต่อกับอำเภอกันตัง
• ทิศตะวันตก ติดต่อกับทะเลอันดามัน

อำเภอสิเกาเป็นที่ตั้งของอุทยานแห่งชาติทางทะเลหาดเจ้าไหม และมีคลองที่สำคัญ ได้แก่ คลองกะลาเส, คลองสิเกา, คลองสว่าง และ คลองฉางหลาง