• ไวโทริน (Vytorin-ezetimibe;simvastatin) เป็นยาลดคอเลสเตอรอลตัวแรก
• ซิมวาสแตติน (Zocor-simvastatin) เป็นยาลดคอเลสเตอรอลประเภทสแตติน เช่นเดียวกับไวโทริน
• ฟินาสเตอไรด์ (Propecia-finasteride) ยารักษาผมร่วง
• อะพรีปิแตนต์ (Emend-aprepitant) ยารักษาอาการคลื่นไส้อาเจียน
• อะเลนโดรเนต (Fosamax-alendronate) ยารักษาภาวะกระดูกพรุน
• มอนเทลูกาสต์ (Singulair-montelukast) สำหรับการรักษาโรคหืด
• อินดาวิเนียร์ (Crixivan-indavinir) ยารักษาเชื้อ HIV
• ไรซาทริปแทน (Maxalt-rizatriptan) รักษาไมเกรน
• อีซีติมิบี (Zetia-ezetimibe) ส่วนผสมของไวโทริน

เมอร์คเป็นเจ้าของสิทธิบัตรยารักษาโรคเอดส์ชนิดดื้อยา "เอฟฟาไวเรนซ์" (Efavirenz) ซึ่งถูกทางการไทยประกาศมาตรการบังคับใช้สิทธิ เมื่อเดือนมกราคม พ.ศ. 2550 และทางการบราซิลประกาศบังคับใช้สิทธิ์เมื่อเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2550