ระบบอาชีพในเกมไฟนอลแฟนตาซี III นั้น จะให้ผู้เล่นสามารถเลือกอาชีพให้แก่ตัวละครได้โดยอิสระ โดยในรุ่นแฟมิคอม ผู้เล่นจำต้องมีจำนวน C จำนวนหนึ่งในการเลือกอาชีพตามจำนวน C ที่ต้องการ ส่วนในรุ่นดีเอส ผู้เล่นสามารถเปลี่ยนอาชีพได้ทันทีโดยการพัฒนาพลังของแต่ละอาชีพจะยังไม่สมบูรณ์จนกว่าจะครบจำนวนการต่อสู้ที่ต้องการ ในรุ่นดีเอสจะมีระบบใหม่ที่เพิ่มเข้ามาคือระดับของอาชีพ โดยเมื่อผู้เล่นผ่านการต่อสู้เป็นจำนวนครั้งที่กำหนด ระดับอาชีพจะเพิ่มขึ้น โดยเมื่อระดับอาชีพถึง 99 จะได้อาวุธหรือเครื่องป้องกันพิเศษมา บางอาชีพในรุ่นแฟมิคอมจะมีคำสั่งพิเศษเพิ่มขึ้นมา เช่น "ขโมยของ" สำหรับอาชีพขโมย หรือ "กระโดดโจมตี" สำหรับอาชีพอัศวินมังกร ส่วนในรุ่นดีเอสทุกอาชีพจะมีคำสั่งพิเศษเพิ่มขึ้นมาโดยบางอาชีพจะมีคำสั่งพิเศษสองคำสั่ง