ทีมกีฬาของมหาวิทยาลัยมีชื่อเล่นว่า "ไซโคลนส์" (Cyclones) ซึ่งชื่อนี้ตั้งขึ้นเมื่อปี 2438 โดยในขณะนั้นมีชื่อเล่นเดิมว่า "คาร์ดินัลส์" (Cardinals) ในขณะที่เกิดเหตุภัยธรรมชาติพายุทอร์เนโดเข้าถล่มหลายพื้นที่ในรัฐไอโอวา ในขณะเดียวกันทีมอเมริกันฟุตบอลของมหาวิทยาลัย ได้แข่งขันชนะทีมของมหาวิทยาลัยนอร์ทเวสเทิร์น ด้วยคะแนน 36-0 ส่งผลให้หนังสือพิมพ์ชิคาโกทริบยูน พาดหัวข่าวว่า "ไอโอวาไซโคลนถล่มอีแวนสตันทาวน์" ซึ่งทำให้ทางมหาวิทยาลัยได้แนวคิดเปลี่ยนชื่อทีมจาก คาร์ดินัลส์ เดิมมาเป็นชื่อ ไซโคลนส์ และใช้กันจนถึงทุกวันนี้ สีประจำมหาวิทยาลัยคือ สีแดงคาร์ดินัลและสีทอง โดยมีมัสคอตคือ "ไซ" (Cy) ที่เป็นนกคาร์ดินัล โดยเริ่มใช้ตั้งแต่ปี 2497 เนื่องจาก ไซโคลนส์ เป็นสัญลักษณ์ที่ยากต่อการแต่งตัวสำหรับเป็นมัสคอตในสนามแข่งขัน

ทีมกีฬาของมหาวิทยาลัยนั้นร่วมแข่งขันกีฬาในลีกของบิ๊กทเวลฟ์ โดยทีมชายมีการแข่งขัน กรีฑา กอล์ฟ บาสเกตบอล มวยปล้ำ วิ่งครอสส์คันทรี และ อเมริกันฟุตบอล ในขณะที่ทีมหญิงแข่งขัน กรีฑา กอล์ฟ ซอฟต์บอล ดำน้ำ เทนนิส บาสเกตบอล ฟุตบอล ยิมนาสติก วอลเลย์บอล ว่ายน้ำ และ วิ่งครอสส์คันทรี

ผลงาน

• ทัวร์นาเมนต์ 13 ครั้ง - 1944, 1985, 1986, 1988, 1989, 1992, 1993, 1995, 1996, 1997, 2000, 2001, 2005
  • ไฟนอลโฟร์ (Final 4) - 1944
  • อีลิตเอต (Elite 8) - 2000
• เอ็นไอที 3 ครั้งในปี 1984, 2003, 2004

• ทัวร์นาเมนต์ หลายครั้ง
  • อีลิตเอต (Elite 8) - 1999, 2009
  • สวีตซิกซ์ทีน (Sweet 16) - 1999, 2000, 2001, 2009

• โบวล์ถ้วยใหญ่ - ยังไม่เคยเข้าร่วม
• โบวล์ถ้วยเล็ก - 9 ครั้ง - 1971 (ซันโบวล์) 1972 (ลิเบอร์ตีโบวล์) 1977 (พีชโบวล์) 1978 (ฮอลล์ออฟเฟมโบวล์) 2000 (อินไซต์.คอมโบวล์) 2001 (อินดีเพนเดนซ์โบวล์) 2002 (ฮิวแมนิเทเรียนโบวล์) 2004 (อินดีเพนเดนซ์โบวล์) 2005 (ฮิวสตันโบวล์) โดยชนะสองครั้งในปี 2000 และ 2004