ณ วันที่ 28 พฤษภาคม ค.ศ. 2016 เพียงหนึ่งวันหลังจากครบรอบวันเกิดอายุ 17 ปีของมัน ฮารัมเบได้ถูกยิงเสียชีวิตหลังจากที่มีเด็กสามขวบคนหนึ่งเข้าไปในกรงรั้วของมัน เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นถูกบันทึกโดยผู้ที่ยืนดูและอัปโหลดไปยังยูทูบ และได้เป็นไวรอลวิดีโอ[7] เธน เมนาร์ด ซึ่งเป็นผู้อำนวยการสวนสัตว์กล่าวว่า "เด็กได้ถูกลากไป ... หัวของเขากระแทกเข้ากับคอนกรีต นี่ไม่ได้เป็นความอ่อนโยน เด็กตกอยู่ในความเสี่ยง"[8][9][10] ซึ่งการลงมือยิงได้ก่อให้เกิดการถกเถียง[11] ผู้สังเกตการณ์บางคนกล่าวว่ามันไม่ชัดเจนว่าฮารัมเบจะเป็นอันตรายต่อเด็กหรือไม่[12][13] และบุคคลอื่นยังเรียกร้องให้พ่อแม่ผู้ปกครองของเด็ก และ/หรือสวนสัตว์รับผิดชอบต่อการตายของกอริลลา[14] ส่วนตำรวจกำลังตรวจสอบความผิดทางอาญาที่เป็นไปได้ ในขณะที่พ่อแม่ของเด็กชายได้ออกมาแก้ต่างให้กับทางสวนสัตว์[15][16][17]

เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นได้รับการเผยแพร่ไปทั่วโลก; ริคกี เจอร์เวส, ไบรอัน เมย์ และเพียร์ส มอร์แกน ได้ติเตียนต่อการยิงดังกล่าว[18] ในขณะที่ดอนัลด์ ทรัมป์ และแจ็ค ฮันนา ได้แก้ต่างให้ต่อการกระทำจากทางสวนสัตว์[19] ส่วนฟรองส์ เดอ วาล ผู้เป็นนักวานรวิทยาก็ได้แสดงความเห็นต่อประเด็นถกเถียงนี้[20]