บริษัทไฟเซอร์ผลิตวัคซีนในโรงงานตนเองโดยมีกระบวนการ 3 ขั้นตอนขั้นตอนแรกทำที่โรงงานนำร่องเล็ก ๆ ในสหรัฐ (เมืองเซนต์หลุยส์ รัฐมิสซูรี) ซึ่งโคลนพลาสมิดของดีเอ็นเอที่เข้ารหัสโปรตีน spike ของไวรัสโควิดโดยให้มันเข้าไปในแบคทีเรีย Escherichia coliหลังจากให้ไวรัสเพาะพันธุ์ในแบคทีเรียเป็นเวลา 4 วัน แบคทีเรียก็จะตายแล้วแตกออก สิ่งที่อยู่ในเซลล์ก็จะทำให้บริสุทธิ์เป็นเวลาสัปดาห์ครึ่งเพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์ดีเอ็นเอที่ต้องการแล้วเก็บไว้ในขวดเล็ก ๆ และแช่แข็งเพื่อส่งการขนส่งดีเอ็นเออย่างปลอดภัยและรวดเร็วในขั้นนี้สำคัญจนกระทั่งต้องใช้เครื่องบินและเฮลิคอปเตอร์ของบริษัทเองช่วยขนส่ง[101]

ขั้นตอนที่สองทำที่โรงงานในสหรัฐ (รัฐแมสซาชูเซตส์) และเยอรมนีดีเอ็นเอที่ได้จะใช้เป็นแบบสร้างสายเอ็มอาร์เอ็นเอที่ต้องการซึ่งเมื่อสร้างและทำให้บริสุทธิ์แล้ว ก็จะแช่เแข็งในถุงพลาสติกเท่ากับถุงช็อปปิ้งใหญ่ ซึ่งแต่ละถุงจะมีวัสดุที่ใช้ทำวัคซีนได้ถึง 5-10 ล้านโดสถุงจะใส่บนชั้นวางพิเศษบนรถบรรทุกเพื่อส่งไปยังโรงงานลำดับต่อไป[101]

ขั้นตอนที่สามทำที่โรงงานในสหรัฐ (เมืองแคละมะซู รัฐมิชิแกน) และประเทศเบลเยียมซึ่งรวมเอ็มอาร์เอ็นเอเข้ากับอนุภาคนาโนที่เป็นลิพิด (lipid nanoparticle) แล้วบรรจุใส่ขวด ใส่ขวดในกล่อง แล้วแช่แข็ง[101]บริษัทลูกของ Avanti Polar Lipids คือ Croda International เป็นผู้ผลิตลิพิดที่ว่า[102]จนถึงเดือนพฤศจิกายน 2020 จุดคอคอดในกระบวนการผลิตก็คือการรวมอาร์เอ็นเอกับลิพิดในขั้นนี้[101]